Kluczowa miejska instytucja kultury, jeden z najważniejszych Partnerów w obszarze badań, promocji i edukacji architektury międzywojennej Gdyni, w tym architektury modernistycznej. Muzeum organizuje prelekcje, spacery, warsztaty, a także wystawy tematyczne. Część wystawy stałej „Gdynia Dzieło otwarte”, została poświęcona międzywojennej architekturze Gdyni, w tym wczesnofunkcjonalnej architekturze Śródmieścia Gdyni oraz jej architektom, planistom i budowniczym. Muzeum było także Partnerem i współwykonawcą nagradzanej wystawy „Gdynia – Tel Awiw”, wspólnie z Muzeum Pollin w Warszawie, a także wystawie monograficznej „NARODZINY MIASTA. GDYŃSKI MODERNIZM W DWUDZIESTOLECIU MIĘDZYWOJENNYM”, opracowanej w 2014 pod kuratelą dr. Jacka Friedricha, ówczesnego dyrektora Muzeum.
Muzeum Miasta Gdyni, realizując swoją misję, prowadzi liczne działania skupione wokół gdyńskiej architektury. Ochrona, edukacja i zwiększanie świadomości w zakresie modernistycznego dziedzictwa są kluczowe, aby zachować je dla kolejnych pokoleń. Tę funkcję pełnią przygotowywane przez Muzeum Miasta Gdyni wystawy, w tym wielokrotnie nagradzana ekspozycja „Szkło, metal, detal. Gdyński modernizm w szczegółach” oraz publikacje, jak katalog wspomnianej wystawy czy – przygotowany z myślą o najmłodszych odbiorcach – „Pan Nowoczesny. Barwne życie w białej Gdyni”. Wątki związane z architekturą obecne są też na stałej wystawie „Gdynia – dzieło otwarte”. Bogaty program Ośrodka Edukacji, w którego skład wchodzą lekcje muzealne, warsztaty i oprowadzania, ma za zadanie poszerzać wiedzę o gdyńskim modernizmie i edukować odbiorców w zakresie zachowania dziedzictwa architektonicznego. Wszystko po to, by dotrzeć zarówno do badaczy, historyków i konserwatorów, ale przede wszystkim do miłośników detalu architektonicznego, mieszkańców modernistycznych kamienic i odwiedzających Gdynię turystów.
Flagowymi projektami instytucji są obecnie także strony internetowe, stanowiące ważne repozytorium wiedzy oraz zasobów wizualnych:
Zespół Muzeum prowadzi także z powodzeniem działalność wydawniczą, przygotowując i publikując projekty związane także z historią architektury międzywojennej.
Kuratorzy wystaw muzealnych związanych z modernizmem: Dariusz Małszycki, Weronika Szerle, Anna Śliwa.
